Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COBLL1Q53SF7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COBLL1Q53SF7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms