Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms