Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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