Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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UPP1Q16831 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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UPP1Q16831 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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