Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms