Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NRF1Q16656 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms