Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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