Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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