Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP13Q15645 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms