Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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