Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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