Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF6Q15052 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms