Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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