Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms