Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
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