Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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