Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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