Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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