Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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