Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB2AQ13885 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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