Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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