Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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