Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms