Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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