Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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