Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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