Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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SEMA3BQ13214 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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