Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms