Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.9 ms