Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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FOXF2Q12947 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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