Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXF1Q12946 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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