Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CHD3Q12873 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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