Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms