Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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