Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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