Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms