Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms