Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms