Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLEQ07864 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLEQ07864 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLEQ07864 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms