Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms