Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms