Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms