Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms