Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms