Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms