Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms