Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms