Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPCQ01831 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms