Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms