Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms